Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 HNRNPH1-246ENST00000523449 793 ntTSL 313.4□□□□□ -0.265e-20■□□□□ 9.1
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TARDBPQ13148 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 212.49□□□□□ -0.415e-20■□□□□ 9.1
TARDBPQ13148 HNRNPH1-206ENST00000502904 2913 ntTSL 29.66□□□□□ -0.865e-20■□□□□ 9.1
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TARDBPQ13148 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-6■□□□□ 8.8
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TARDBPQ13148 HEXDC-205ENST00000578616 862 ntTSL 313.2□□□□□ -0.32e-6■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-6■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-8■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.642e-6■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 SRP9-202ENST00000366838 540 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.652e-6■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 TTL-201ENST00000233336 14269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 TTL-202ENST00000460450 4148 ntTSL 28.33□□□□□ -1.082e-6■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.083e-8■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.282e-6■□□□□ 8.8
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TARDBPQ13148 METTL8-210ENST00000460539 677 ntTSL 35.18□□□□□ -1.582e-6■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 INTS8-207ENST00000520526 2482 ntTSL 1 (best)4.58□□□□□ -1.682e-6■□□□□ 8.8
TARDBPQ13148 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.233e-11■□□□□ 8.8
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TARDBPQ13148 SNHG5-215ENST00000623163 851 ntTSL 514.84□□□□□ -0.033e-11■□□□□ 8.8
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