Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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