Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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BNIP1Q12981 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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BNIP1Q12981 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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BNIP1Q12981 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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BNIP1Q12981 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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BNIP1Q12981 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP1Q12981 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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