Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTP4A2Q12974 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms