Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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GRIN2AQ12879 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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GRIN2AQ12879 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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GRIN2AQ12879 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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GRIN2AQ12879 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
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GRIN2AQ12879 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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GRIN2AQ12879 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
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GRIN2AQ12879 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIN2AQ12879 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
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