Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GTF3C1Q12789 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF3C1Q12789 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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