Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms