Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms