Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms