Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TNP2Q05952 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms