Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP27A1Q02318 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms