Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms