Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN7AQ01118 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms