Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCQ00610 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms