Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms