Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK3Q00526 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms