Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX1P78337 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX1P78337 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX1P78337 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX1P78337 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX1P78337 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX1P78337 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX1P78337 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX1P78337 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX1P78337 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX1P78337 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms