Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVPABLB-1P60509 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVPABLB-1P60509 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms