Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRP55822 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BGRP55822 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms