Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDST1P52848 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDST1P52848 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDST1P52848 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDST1P52848 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDST1P52848 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDST1P52848 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDST1P52848 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDST1P52848 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDST1P52848 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDST1P52848 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDST1P52848 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDST1P52848 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDST1P52848 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDST1P52848 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDST1P52848 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDST1P52848 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDST1P52848 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDST1P52848 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDST1P52848 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDST1P52848 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDST1P52848 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NDST1P52848 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NDST1P52848 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms