Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLK1P49759 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLK1P49759 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLK1P49759 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLK1P49759 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLK1P49759 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLK1P49759 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms