Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRP9P49458 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP9P49458 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP9P49458 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP9P49458 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRP9P49458 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms