Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
POU3F4P49335 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms