Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A3P48764 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A3P48764 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms