Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRXP46100 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRXP46100 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRXP46100 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRXP46100 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRXP46100 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRXP46100 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATRXP46100 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATRXP46100 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATRXP46100 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATRXP46100 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATRXP46100 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms