Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3CBP42338 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms