Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TGFBR1P36897 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms