Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms