Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXD13P35453 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms