Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCAP28676 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCAP28676 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCAP28676 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms