Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms