Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NFKBIAP25963 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms