Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LMO1P25800 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LMO1P25800 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LMO1P25800 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms