Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTSSP25774 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSSP25774 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSSP25774 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSSP25774 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSSP25774 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTSSP25774 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSSP25774 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms