Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM27P14373 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms