Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms