Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FAM200BP0CF97 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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