Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYBBP04839 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms