Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
F9P00740 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
F9P00740 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
F9P00740 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
F9P00740 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
F9P00740 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
F9P00740 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
F9P00740 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
F9P00740 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
F9P00740 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
F9P00740 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
F9P00740 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
F9P00740 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
F9P00740 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
F9P00740 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
F9P00740 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms