Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP4K4O95819 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms