Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJB6O95452 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJB6O95452 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB6O95452 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB6O95452 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB6O95452 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB6O95452 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB6O95452 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB6O95452 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB6O95452 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB6O95452 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB6O95452 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB6O95452 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms