Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms