Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ABCC9O60706 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ABCC9O60706 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms