Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTATSF1O43719 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTATSF1O43719 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms