Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNA1GO43497 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA1GO43497 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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