Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TXNDC9O14530 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms