Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN8O00124 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms