Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC4-APOC2K7ER74 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms