Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms