Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOBPA7XYQ1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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